حدد القانون رقم 139 لسنة 2021 الخاص بإنشاء صندوق الطوارئ الطبية التشكيل الخاص بمجلس أمناء الصندوق، حيث نص على أن يُشكل مجلس الأمناء برئاسة رئيس مجلس الوزراء، وعضوية كل من :
محافظ البنك المركزى المصرى، وينوب عن الرئيس حال غيابه .
وزير الصحة والسكان .
وزير المالية .
وزير التعليم العالى والبحث العلمى .
وزير التضامن الاجتماعى .
ثلاثة أعضاء من الشخصيات العامة وذوى الخبرة ، يختارهم رئيس مجلس الوزراء، لمدة أربع سنوات قابلة للتجديد لمدة أخرى مماثلة .
ويصدر بتشكيل مجلس الأمناء قرار من رئيس مجلس الوزراء