يصنف المتخصصون مكتبة دير سانت كاترين، بأنها ثانى أهم مكتبة فى العالم، من حيث قيمة المخطوطات المسيحية المقدسة وعددها، بعد مكتبة الفاتيكان.
ويبلغ عدد مخطوطات، حسب مركز المعلومات ودعم اتخاذ القرار، فى المكتبة 4500 مخطوط، تم كتابة ثلثيها باللغة اليونانية، كما يوجد بالمكتبة مرجع أرشيفى يحوى مراسلات من وإلى رؤساء الدير والأباطرة وكذلك مدونات أثرية وخرائط وصور.
ومن أهم مخطوطات المكتبة ووثائقها
نسخة من الأناجيل الأربعة، وهو مخطوط يرجع إلى القرن الثالث الهجري.
مخطوط التوراة اليونانية، والمعروف باسم "كودكس سيناتيكوس" أو "توراة سينا"، الذى يضم العهد القديم والجديد.
ويرجع تاريخ المكتبة للقرن السادس، وتضم مجموعة مهمة وفريدة من الوثائق والمستندات الدينية والتاريخية، والمكتبة كانت بها نسخ الكتاب المقدس، لكن سرقت ونقلت لروسيا القيصرية وبيعت للمتحف البريطانى فى لندن، وبين سنة 1949 و 1950 صورت بعثة مصرية - أمريكية محتويات المكتبة على ميكروفيلم ووضعت نسخ منها فى جامعة الإسكندرية، ونشرت أبحاث وفهارس مهمة عن طريق العلماء والباحثين.